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联想助推“算力抗疫”

2022年06月23日
       新冠疫情的爆发在某种意义上开启了全球制药业的新篇章, 制药企业必须比以往更快地研发疫苗和治疗方法。 通常, 一种新药从新药发现到批准上市需要十年以上的时间。
        然而, 自今年年初新冠疫情暴发以来, 一些实验室和跨国药企在不到一年的时间里就进入了疫苗和治疗的后期研发阶段, 以期帮助全人类重返社会。 尽快的日常生活。 但许多卫生专家认为,

新冠病毒可能不是最后一次全球大流行。 因此, 专家强调需要开发一个平台, 以便在下一次全球大流行的情况下更快地开发安全有效的治疗方法。 在此背景下, 联想数据中心集团认为, 基于联想基因组测序软件的精准给药, 未来可能为此类医疗问题提供解决方案。 “我们的数据中心团队专注于评估最新的高性能计算 (HPC) 技术, 以带来创新并为科学探究节省时间, ”HPCAI 联想数据中心集团生命科学全球负责人 Mileidy Giraldo 在最近的一次采访中说 . ”。Giraldo 还提到, 联想一直在利用这项技术围绕“组学分析”构建强大的计算能力, 包括基因组学、转录组学和蛋白质组学等多个领域, 因为目前几乎所有的生物医学项目都依赖于高性能计算机。“测序和 在过去的 20 年中, 基因组分析成本大幅下降, 并且更容易利用现有技术进行扩展。 与 1990 年第一次基因组测序花费 13 年和 300 万美元相比, 现在整个过程只需花费大约 1000 美元和几天, 时间和成本都大幅下降。”Giraldo 补充说, 在 COVID 领域 -19治疗, 许多公司也一直在使用组学分析来解决未知问题, 例如新冠病毒的感染机制和宿主免疫反应。但是,

为了使疾病分析更具可扩展性, 仍然需要进一步确保 基因组分析的处理速度更快、成本更低、使用方便、安全。为此, 联想集团于11月推出了GOAST(Genome Optimization and Scalability Tool)系统, 与目前的传统技术相比, 可进一步降低成本和时间 . 传统上, 处理全基因组测序 (WGS) 所需的时间以天为单位来衡量, 但 GOAST 系统配置仅使用 CPU, 不到一个小时即可得出结果。没有其他的 公司目前能够在不使用昂贵的专用硬件(如 GPU 和 FGPA(现场可编程门阵列))的情况下实现这样的结果。 然而, 大多数研究机构, 包括小型实验室, 都负担不起使用专门的硬件设备。 GOAST 提供了两个程序——GOAST-Base 和 GOAST-Plus(后者是升级版)。 这两个系统都提供了经过特殊调整的硬件, 其中包括正确的 HPC 组件、优化的基因组学和预配置的软件, 以最大限度地提高研究工作所需的 HPC 能力。 通过使用 GOAST 系统, 实验室可以使用基因组分析结果来提高生产力并增加产量, 同时该系统还更便宜、更易于操作且用途更广泛。 Giraldo 谈到 GOAST 的短期和长期目标时表示, 联想的目标是让需要的人可以使用该解决方案, 并最终将其推广到从小型实验室到大型制药公司的每个人。 “同时, 我们希望降低运营门槛, 任何人都可以创造出很棒的解决方案, 但如果很难上手,

很少有人能接受这项技术。因此, 联想希望这项技术易于学习。 从长远来看, 联想将继续专注于最新技术, 不断突破 GOAST 系统的性能极限。” 中国目前在生物制药和医疗器械的研发和制造方面具有非常广阔的前景,

市场趋势也正在转向数字健康。 未来生物制药行业利用HPC、AI等技术助力药物研发, 将产生事半功倍的效果。 联想集团GOAST系统等一系列解决方案的推出, 将成为医药与科技领域更紧密融合的基石。
       
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